В фильме "Наследие доктора Смерть: Чёрный файл" детективы Хаято Инукай и Асука Такатиро сталкиваются с загадочной серией смертей среди неизлечимо больных пациентов. Каждое расследование приводит их к таинственному доктору Смерть, который предлагает эвтаназию по просьбе страдающих. В то время как детективы погружаются в мрачный мир этих решений, личная драма накаляется: дочь Хаято, Саяка, страдает от тяжелого заболевания почек и обращается за помощью к доктору Смерть. С каждым новым открытием детективы осознают, что границы между жизнью и смертью могут быть более размытыми, чем они думали.